中国医学科学院1956年成立。北京协和医学院1917年成立。中国医学科学院和北京协和医学院自1957年起实行院校合一的管理体制。作为我国最高医学研究机构和最高医学教育机构，院校自成立以来始终以引领我国医学科技教育发展和维护人民健康为己任，为我国医学卫生健康事业的发展做出了重要贡献。院校至今已发展成为拥有23个研究所（院、基地）、6家医院、7所学院、56个创新单元，集医教研防产为一体的国家医学科学中心和综合性医学科学研究机构。