学校溯源于光绪三十三年（1907年）创设的崇文学堂，校址为清代江宁府署箭道、西花园旧址。不久思益学校（1903年创办）并入，其后学校三易校名。至2019年4月，学校有高中教学班39个，在校学生约1900人。在编教职工共213人。学校本部位于中山南路301号，现有南京一中初中部、南京实验学校、南京求真中学、南京晓庄学院附属中学、南京一中明发滨江分校、南京一中马群分校、南京一中高淳分校、南京一中江北分校等联盟学校。