继续教育中心成立于2018年12月，属于鄂尔多斯应用技术学院的系部之一，继续教育中心的前身为鄂尔多斯市卫生学校，始建于1959年，是自治区唯一一所使用蒙汉两种语言文字授课的卫生职业院校。同时是国家级重点中等职业学校，国家级中等职业教育改革发展示范学校。