中心是根据国务院《住房公积金管理条例》和建设部等九部委《关于住房公积金管理机构调整工作的实施意见》(建房改[2002]150号)及自治区有关精神，经盟编委研究成立的不以盈利为目的隶属于盟住建局的相当副处级事业单位。

中心内设办公室、财务科、信贷科、归集科、稽核科5个职能科室和直属、阿拉善左旗、阿拉善右旗、额济纳旗、阿拉善经济开发区、腾格里经济技术开发区6个旗区管理部。

中心主要职责：

（一）负责全盟住房公积金中心的归集、使用计划；

 （二）记载职工住房公积金缴存、提取、使用等情况；

（三）住房公积金的核算；

（四）审核住房公积金的提取、使用、和放贷；

（五）负责住房公积金的保值和归还等工作。