中心前身为新疆维吾尔自治区纤维检验局，属参公管理单位。随着机构改革的深入，根据《关于自治区市场监督管理局所属事业单位机构编制调整的通知》新党编［ 2019 ］ 37号文件精神，“自治区纤维质量检验局”于2019年8月变更为“自治区纤维质量监测中心”，属公益一类事业单位，经费实行全额预算管理，机构规格为县（处）级。其中：下属1个公益二类事业单位，为自治区纤维纺织产品质量监督检验研究中心，机构规格为正科级。

自治区纤维质量监测中心主要职责：承担全区纤维及纤维制品的检验检测，纤维公证检验的监督抽验、监测工作;全区纤维检验机构实验室检验工作的技术指导。目前，中心检验检测能力涵盖棉花、毛绒、棉纱、面料、针织、服装、纺织品、化纤、羽绒羽毛等纤维检验监测项目，包括十二大类131个产品，可实现棉花全项的检验检测。