云南省地质矿产勘查开发局成立于1957年，是原国家地矿部派驻云南省的厅局级事业单位，主要从事国家计划内地质勘查和地质找矿工作。

1999年，由国土资源部划归云南省人民政府管理，并加挂省地矿厅牌子，履行全省地矿行政管理职能，实行厅局“一套机构、两块牌子”管理。

2018年10月，在机构改革中，调整划归省自然资源厅管理。主要职责为研究制定省地质矿产勘查开发局改革与发展战略、政策、措施并组织实施；组织实施自然资源调查、地质灾害防治、国土空间生态修复和土地整治等技术服务工作；组织实施区域地质、矿产地质调查和矿产资源勘查，以及水文地质、工程地质、环境地质和重大建设项目前期地质工作；承办省委、省政府和省自然资源厅交办的其他事项。