2005年3月28日，在国务院关于深化农村信用社改革的金融方针指引下，经云南省委、省政府和中国银监会批准，云南省农村信用社联合社正式成立。省联社受省委委托，对全省农信社党的工作实行“垂直领导、统一管理”，受省政府委托，履行对全省农信社“管理、指导、协调、服务”职能。目前，全省农信社形成了以省联社为核心、2个市联社、14个州市办事处、98个县级联社、3个农合行、29个农商行为一体的三级法人体系。