学校前身是创建于1954年的杭州市第三中学。1996年7月，杭州市第三中学与红星职高合并更名为中策职高，初高中分离，原初中部搬迁到大关小区筹建大关北中学，后更名为杭州市行知中学。学校地处城北大关小区，是杭州市唯一一所以伟大的人民教育家陶行知先生名字命名的公立全日制普通初级中学。学校占地1.97万平方米，建筑面积1．40万平方米，绿化面积4570平方米，2010年至2012年学校结合校安工程分三期对教学楼、体百馆、综合楼、生活楼进行了改造，2013年至2014年，又对校园和操场实施了整体提升工程。目前，学校拥有教学楼、综合楼、实验楼、体育馆、地下停车库及生活楼等；且按国家一级标准配有物理、生物、化学等多个实验室，有计算机房、微格教室、电子阅览室等专用教室，塑胶篮球场和标准化足球场等配套设施；2015年学校还建成了包括3D创意、陶艺、棋类、京剧、摄影等多个社团专用教室，教学配套日渐完善。