医院坐落于呼和浩特市中心，与内蒙古自治区中医药研究所合署办公，其前身为内蒙古自治区中蒙医医院（始建于1958年）和内蒙古自治区中蒙医研究所（始建于1956年）。2013年，正式更名为内蒙古自治区中医医院。现已发展成为内蒙地区唯一一所集医疗、教学、科研、康复、保健、制剂、养生于一体的自治区级三级甲等综合性中医医院。医院占地面积2.5万平方米，总建筑面积达8万平方米，编制床位1000张。医院设有临床科室45个，医技科室9个，病区26个。