医院正式建立于1973年，前身为始建于1968年的垂杨柳门诊部，2004年第二冠名北京微创医院，是北京市朝阳区政府举办的集医疗、教学、科研、预防为一体的三级综合医院，北京市核定的地区性医疗中心，朝阳区南部医联体牵头单位;是清华大学附属医院，河北医科大学和华北理工大学教学医院;也是国家药物临床试验机构，北京市医保A类定点医疗机构。医院共设临床、医技56个，具备较强的综合诊治能力。