医院是国家发展改革委员会批准的第一批国家区域医疗中心建设试点单位，由安徽省政府和复旦大学附属儿科医院依托安徽省儿童医院合作共建，为政府举办的公益性医疗机构。分本部和新院两个院区。目前，医院是国家发展改革委、国家卫生健康委首批 “国家区域医疗中心”试点建设项目，发展目标是建成集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的国内一流、省内领先的儿童专科医院。医院秉承“一切为了孩子”的服务理念，努力为儿童提供安全、有效、方便、价廉的医疗卫生服务。